該核心的職能包括：確保在食品中添加的物質及色素的平安；確保通過生物工藝開發的食品和配料的平安；負責在正確標識食品（如成分、營養健康聲明）和化妝品方面的管理活動；制定相應的政策和法規，以管理膳食補充劑、嬰兒食物配方和診療食品；確?；瘖y品成分及產品的平安，確保正確標識；監督和規范食品行業的售后行為；進行消費者教育和行為拓展；與州和地方政府的合作項目；協調國際食品標準和平安等。
2、藥品評估和研究核心（CDER):
該核心旨在確保處 方藥和非處 方藥的平安和有用，在新藥上市前對其進行評估，并監督市場上銷售的一萬余種藥品以確保產品滿足不斷更新的非常高標準。同時，該核心還監管電視、廣播以及出版物上的藥品的廣告的真實性。嚴格監管藥品，提供給消費者準確平安的信息。
3、設備平安和放射線保護健康核心（CDRH):
該核心在確保新上市的診療器械的平安和有用。因為在世界各地有兩萬多家企業生產從血糖監測儀到人工心臟瓣膜等超過八萬種各種類型的診療器械。這些產品都是同人的生命息息相關的，因而該核心同時還監管全國范圍內的售后服務等。對于一些象微波爐、電視機、移動電話等能產生放射線的產品，該核心也確定了一些相應的平安標準。
4、生物制品評估和研究核心（CBER):
該核心監管那些能夠預防和診療病疼的生物制品，因此比化學綜合性藥物更加復雜，它包括對血液、血漿、疫苗等的平安性和有用性進行科學研究。
5、獸用藥品核心（CVM):